バスが一般的です。
船：料金は高く、運休日あり、時間は同じくらい
電車：空港内に駅はなく、新大村駅まで移動する必要あり
●バス
時間：60分
料金：大人1.250円（子供630円）
便数：1時間に1本程度
※予約は不要
●船
時間：50分
料金：大人2.200円（子供1,100円）
便数：1日2便
※大村空港発は先着順
バス
佐世保・佐々方面行で、ハウステンボス経由のバスになります。
長崎空港の正面玄関出て、２番乗場です。
時間：60分
料金：大人1.250円（子供630円）
※予約は不要
時刻表例
10月から新大村駅で降車可能に
2023年10月から、新大村駅経由になりました。
新大村駅で降りると、JRでハウステンボスまで移動できます。
・長崎空港ー新大村駅：バス_12分_260円
・新大村駅ーハウステンボス：JR_40分_660円
ハウステンボス行のバスなので、降車しJRに乗り換えるメリットは、ほぼないと思います。
船
長崎空港ーハウステンボス間は、船でも移動できます。
到着は、ハーバーゾーンです。
料金：2,200円（往復割1,700円）
時間：50分
時刻表例
注意点
・大村空港は先着順（予約不要）
・基本は土日祝のみ運行
・1日2便
料金や時間の面でのメリットはないですが、船移動は、非日常感があって面白いですね。
注意点
・電車は出ていない
・便が少ない時間帯がある（飛行機の時間に注意）
長崎空港vs福岡空港
長崎空港のほうが、移動時間は短いです。（長崎空港60分、福岡空港120分）
個人的には、長崎空港がおすすめです。
空港からの移動も楽しむ
空港から移動に時間がかかるのは、少し嫌です（特にデートなどでは…）
オフィシャルホテルの「ホテルヨーロッパ」や「アムステルダム」を利用すれば、長崎空港からホテルまでの送迎があります。
けっこうおすすめです。
レンタカーやパスポート付などプランが豊富なので、ハウステンボスを運営していたHISも確認してください。
