長崎空港ー市街地は、バス（出島道路経由_ノンストップ）が速くて安いです。
空港にJR駅はありません。
在来線や「新幹線かもめ」に乗るには、バスやタクシーなどで「新大村駅」まで行く必要があります。
目次
バス：1,200円
経路：長崎空港―長崎駅
料金：1,200円
時間：50分
経由するバス停により、2種類あります。
①出島道路経由（ノンストップ）
②昭和町経由
※①、②ともに長崎駅経由
長崎市中心部なら、①出島道路経由（ノンストップ）が速いです。
②は、料金は同じで15分ほど長くなります。
JR：1,360円
経路：長崎空港―新大村駅（大村駅）―長崎駅
料金：1,360円（500円＋860円）
時間：1時間
空港内に駅はないので、新大村駅まで移動します。
長崎空港―新大村駅（または大村駅）
バス：260円_12分
新大村駅―長崎駅
在来線：860円_1時間
新幹線：2,020円（指定席）または1,630円(自由席)_15分
※本数は多くないので、時間の確認が必要です
JRに乗るメリットは小さく、一般的ではありませんが、新幹線利用なら楽しいと思います。
タクシー：11,300円
経路：長崎空港―長崎駅（例）
料金：11,300円
時間：40分
料金は高いですが、早くて自由に移動できます。
連絡船：1,600円
経路：長崎空港―時津港
料金：1,600円
時間：25分
時津港行きです。
観光客の方は、基本的に利用しないと思います。
まとめ
長崎空港から市街地までは、バス（出島道路経由_ノンストップ）が速くて安いです。