どちらも、会員登録が必要な「東海道・山陽・九州新幹線のネット予約サービス」のことです。
新幹線に特化しています。
記事の最初と最後に、公式サイトのURLを載せておきます。
【公式サイト】
スマートEX：ホーム、設定区間
EX予約 ：ホーム、設定区間
早特 ：商品一覧
概要
大きな違いは、①無料か有料か、②割引率、です。
スマートEX
・年会費無料
・200円割引～
EX予約
・年会費1,100円
・年会費に近い割引設定（例：990円～1,770円）
・e特急券＝特急券のみ安く購入できる（例：790円～2,350円）
どちらの会員も利用できる「早特」
2023年9月から、「早特」の内容は変更されています。
・EX早特１
・EX早特３
・EX早特７
・EX早特21ワイド
・EX早特28ワイド
・EXグリーン早特３ワイド
・EXこだまグリーン早特３
・EXのぞみファミリー早特３
・EXこだまファミリー早特３
数字の日数前まで予約です（例：EX早特７＝7日前まで）
「EX早特」が無い区間もあります。
料金比較の一例
東京―新大阪間
通常 ：14,720円
スマートEX ：14,520円（-200円）
EX予約 ：13,620円（-1,100円）
東京―広島間
通常 ：19,760円
スマートEX ：19,240円（-520円）
EX予約 ：17,990円（-1,770円）
無料の「スマートEX」でも、有料の「EX予約」でも、通常料金と比較すれば、お得です。
「早特」
「スマートEX」または「EX予約」の会員は、「早特」きっぷを利用できます。
1日前までの予約で、割引料金が設定されています。（限定枚数あり）
区間によって、割引率は異なります。
東京―広島間の例
通常 ：19,760円
スマートEX ：19,240円
EX予約 ：17,990円
EX早特７ ：16,190円（７日前）
EX早特21ワイド：15,000円（21日前）
「早特」を利用できれば、どちらの会員でもかなりお得です。
販売枚数は、「EX予約」会員分のほうが多いようです・・・
注意点
「スマートEX」と「EX予約」は、新幹線区間に特化しています。
新幹線区間以外に在来線の乗継ぎがあれば、別途、乗車券の購入が必要です。
JR移動全体での割引が無いので、在来線の距離によっては、合計金額が割高になる可能性もあります。
・「EXサービス」のみ利用する
・「EXサービス」でe特急券を購入し、別途、乗車券を購入する
・「EXサービス」を利用せずに、通常購入する
全体の移動区間によって、使い分けてください。
まとめ
新幹線区間の移動なら、「スマートEX（無料）」や「EX予約（年1,100円）」は、基本的にお得です。
「EX予約」の年会費1,100円は、すぐに元を取ると思います。
ただし、在来線を乗継ぐ場合や、JR各社の割引きっぷがある場合は、安くならないこともあります。
移動区間には要注意です。