姫路駅―長崎駅を起点に、移動を比較します。
新幹線：バリ得＋早割で安い
飛行機：早期予約で安い
夜行バス：安い
新幹線（13,200円、4時間）
経路：姫路駅―博多駅（新鳥栖駅）―武雄温泉駅―長崎駅
料金：13,200円～19,980円
時間：4時間～
利用列車例
姫路駅―博多駅 ：新幹線
博多駅―武雄温泉駅：特急（かもめ）
武雄温泉駅―長崎駅：新幹線（かもめ）
通常料金例
指定席：19,980円
自由席：18,180円
往復割
指定席：18,920円
自由席：17,120円
学割
指定席：17,860円
自由席：16,060円
割引料金例
姫路―博多間
バリ得 ：10,000円（※4月値上げ）
※便によって、移動時間はあまり変わらず、安いです。
博多―長崎間
かもめネット：4,200円
早特３：3,600円
早特７：3,200円
最安値では、13,200円からです。
宿泊込み
私おススメの「ホテルフォルツァ」利用で、JTBでは3.5万円からありました。
条件が合えば、安いです。
飛行機（8,000円、4時間）
経路：姫路駅―神戸空港―長崎空港―長崎市街
料金：8,000円～28,000円
時間：4時間（待ち1時間込み）
空港移動例
姫路駅―神戸空港：：1,500円_1時間
長崎空港―長崎市街：1,200円_1時間（バス）
神戸空港―長崎空港
会社：スカイマーク
料金：5,000円～25,000円
時間：1時間
早期に予約できれば、安くなります。
バス （7,000円、11時間）
経路：姫路駅―神戸三宮―長崎駅
料金：7,000円～
時間：11時間
姫路発の直行便はないようです。
姫路―神戸三宮：約1,000円_40分（JR）
神戸三宮―長崎（夜行バス）
料金：6,000円～
時間：10時間
【楽天高速バス】で検索してください。
車 （17,370円、9時間）
経路：山陽姫路西IC―長崎IC
料金：17,370円
時間：9時間
距離：700km
ETCは9,430円、ガソリン代は7,940円です。
・ETC：普通車の休日料金
・ガソリン：1L=15km=170円
まとめ
新幹線が便利です。
飛行機の早期予約なら、安くなります。
バリ得の利用や、宿泊込みのJTB（3.5万円～）が安くて速いです。